教育的负功能是指教育对个体和社会所产生的阻碍作用和消极影响。在充分肯定实验教育的正功能的同时，不能忽视其产生负功能的可能性。目前实验教育的负功能突出表现在：①科学精神和科学态度的教育方面；②学生实验兴趣的培养方面。深入反思这些负功能的成因，能够使教师保持清醒的头脑，认真改进工作，从而最大限度地消除它们。 作者认为，实验教育负功能产生的原因虽然较为复杂，但多数是人为因素造成的，不是实验教育本身固有、必然产生和不可避免的。要消除实验教育的负功能，应做到：①对实验教育有个全新的、多角度的认识，应把实验教育的负向功能如同正向功能一样同时置于实验教育工作者的视野中，认识到它的存在及其危害性；②提高实验教师队伍的素质，不仅包括道德素质、心理素质、专业素质等，还应有教育科学修养方面的素质，不但要求教师自己的实验技术精湛，而且要懂得如何进行实验教育，以免方法不当产生负面效应。
