目前，研究型课程的开发和实施中存在一些认识误区和行为偏差。一是在实践中传统的知识中心课程观仍然支配着研究型课程的实施。而研究型课程应是一种以经验为本位的生成性课程。其本质属性是完成学生经验的建构。二是把“研究性学习”与“科学研究”等同起来。而研究性学习应是以“研究”为本的学习，其更为深层次的价值追求是复归儿童本性。三是课程的开发存在形式化、随意化现象。研究型课程的开发应坚持规范性、校本性，克服随意性。四是许多教师仍然习惯于做既定课程的执行者、阐释者与传递者。而研究型课程中，教师和学生不仅是传递者和吸收者，又是课程的开发者和创造者。五是课程评价没有摆脱传统的注重选拔的评价。而研究型课程评价的方式应该具有全程性、多元性和欣赏性。
